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沖擊2022國自然,這個標書寫作輔助神器技術(shù)大牛都在用!

時間:2021-10-18 來源: 瀏覽:

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標書寫作神器——PolySearch,一種用于提取人類疾病,基因,突變,藥物和代謝物之間的關(guān)系的基于網(wǎng)絡(luò)的文本挖掘系統(tǒng)。
0 1
PolySearch的由來
首先為大家簡單介紹這篇文章,它是發(fā)表在NucleicAcidsRearch雜志上,它的影響因 子是11.516 ,PolySearch---pubmed 發(fā)表。
看過了摘要的朋友應(yīng)該都知道,該文章的作者想到了在目前為止科學研究的數(shù)據(jù)量極大,但是卻不能有效的處理;還有目前研究的基因組學、蛋白質(zhì)組學或代謝組學涉及很多全面的搜索,但是還沒有開發(fā)有用的工具來支持這些搜索。 因此,作者開發(fā)了PolySearchWeb服務(wù)器。
0 2
PolySearch簡介
網(wǎng)址: http://wishart.biology.ualberta.ca/polysearch
PolySearch是一款集成多搜索引擎的搜索工具,該搜索工具集成了很多實用的功能,通過該搜索引擎可以保存、記錄你的搜索痕跡,該搜索引擎加入了很多智能的交互因素。

1、支持多種(’poly’)類型的數(shù)據(jù)庫中的多種(’poly’)類型的生物醫(yī)學文本搜索。一種可通過Web訪問的工具,專門用于提取和分析人類疾病、基因/蛋白質(zhì)、突變(SNP)、藥物、代謝物、通路、組織、器官和亞細胞定位之間的文本派生關(guān)系。
2、PolySearch有著非常強大的功能, 它支持數(shù)十種不同類型的文本,其次能夠達到50種不同類別的查詢, 主要涉及到的方向是科學摘要和生物信息數(shù)據(jù)庫的查詢。它支持的查詢方式是,“給定X,找到所有Y”,其中X或Y可以是疾病,組織,細胞區(qū)室,基因/蛋白質(zhì)名稱,SNP,突變,藥物和代謝物等等。
3、PolySearch可以利用文本數(shù)據(jù)挖掘和文本數(shù)據(jù)的方式來挖掘,比較能夠體現(xiàn)提取和分析PubMed數(shù)據(jù)的排列,跟另外的數(shù)據(jù)庫做對比的話,它有一個非常顯著的特點就是, 它不僅僅能夠提取和分析PubMed數(shù)據(jù)庫,而且還能還可以實現(xiàn)提取和分析來自DrugBank,SwissProt,HGMD,Entrez SNP等跟多個數(shù)據(jù)庫。
03
PolySearch具體操作
接下來就是詳細介紹PolySearc的操作。 它的搜索功能涵蓋了快速搜索和高級搜索兩個,首先看看如何利用PolySearc進行快速搜索?
快速搜索操作:
1、PolySearch的程序員是用了標準的HTML和Perl對查詢界面進行編寫(如:下圖中,搜索:結(jié)直腸癌相關(guān)的基因或蛋白質(zhì)相關(guān)的研究)。
2、最后搜索出來關(guān)于結(jié)直腸癌與基因或蛋白質(zhì)有關(guān)的研究的結(jié)果有109個,而且還把最可能的基因或蛋白質(zhì),做出了相關(guān)性的排序順序
3、接著點擊Hite,出現(xiàn)了結(jié)直腸癌相關(guān)的COX-2基因詳細描述,其中包括了文獻題目,還有文獻種語句的描述。
4、最后點擊Details,就能夠得到文獻中的詳細描述了。
高級搜索操作:
知道了快速搜索的功能之后,是不是很期待高級搜索呢?不要急,小編這就給你詳細的介紹它的操作方法。
1、在Adanced Options 中能夠限定關(guān)鍵詞/數(shù)據(jù)庫等等(如:限定OMM數(shù)據(jù)庫)。
2、最后點擊提交,出現(xiàn)的結(jié)果是:
3、CheckResults欄,出現(xiàn)的結(jié)果是:
4、在這個工具欄中,能夠用jobID號來檢索以前的搜索結(jié)果。
5、“Thesaurus”欄搜索的結(jié)果是:
PolySearch的功能還是蠻齊全的,需要的小伙伴可以盡情操作起來哦,小編在這里給大家溫馨提示,PolySearch已經(jīng)更新到2.0版本啦!

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